第1節 ペプチドアレイライブラリーの作製法と短鎖機能性ペプチドのスクリーニング
1.はじめに
1.1 ペプチドの多様性
1.2 ペプチドライブラリーの作製
1.3 ペプチドアレイ細胞機能アッセイ法
1.4 アミノ酸配列の残基置換
1.5 ランダムライブラリーの作製と探索
2.配列―機能相関
2.1 コレステロール吸収抑制ペプチドのルール
2.2 細胞接着ペプチドのルール
3.その他の機能性ペプチド探索
3.1 遊離ペプチドライブラリー
3.2 細胞内機能性ペプチドライブラリー
4.おわりに
第2節 新しい生理活性ペプチドの探索法〜迅速・正確にスクリーニングする技術〜
はじめに
1.歴史的背景
1.1 組織からのペプチド抽出・精製法
1.2 平滑筋の収縮・弛緩を指標とした活性検出法
2.生物活性を指標とする新規ペプチド探索
2.2 標的とする受容体
2.2.1 一般的な細胞機能を有する受容体
2.2.2 オーファン受容体
2.3 活性検出系
2.3.1 Gαq共役型受容体の細胞内シグナル検出
2.3.2 Gαs共役型受容体の細胞内シグナル検出
2.3.3 Gαi共役型受容体の細胞内シグナル検出
2.3.4 Gα12/13共役型受容体の細胞内シグナル検出
2.3.5 β-アレスチンを介した細胞内シグナル検出
2.3.6 ラベルフリー技術を用いたシグナル検出
3.生物活性に依存しない新規ペプチド探索
3.1 遺伝子情報からの新規ペプチド探索
3.2 質量分析計を用いた新規ペプチド探索
おわりに
第3節 ファージディスプレイ法と次世代シークエンサーを利用したペプチドの網羅的配列探索・解析
はじめに
1.ランダムペプチドファージライブラリーからの特異的ペプチドの単離
1.1 T7ファージディスプレイライブラリー
1.2 ランダムペプチドライブラリーの構築
1.3 ランダムペプチドライブラリーから特異的ファージの選別の概要
1.4 抗コラーゲンモノクローナル抗体に結合する結合ペプチドの同定
1.5 抗コラーゲンモノクローナル抗体に結合する結合ペプチドの特性解析
2.次世代シークエンサーを利用したペプチドの網羅的配列探索・解析
2.1 NGSを使ったファージライブラリー中のペプチドの網羅的配列解析による結合配列同定
2.2 エピトープペプチド2次ライブラリーからのNGS解析による結合重要残基の同定
おわりに
第4節 mRNAディスプレイ法によるペプチドのスクリーニング
はじめに
1.mRNAディスプレイ法とは
1.1 mRNAディスプレイ法の利点
1.2 mRNAディスプレイ法によるセレクション手順
2.mRNAディスプレイ法によるセレクションの実例
2.1 タンパク質間相互作用阻害ペプチド
2.2 バイオ医薬品に膜透過性を付与するペプチド
おわりに
第5節 構造ゆらぎ抑制ペプチドライブラリーを用いた高性能標的結合ペプチドのスクリーニング法の開発
はじめに
1.蛍光足場タンパク質gFPSの開発
1.1 ペプチドの組み込みに適したループの探索
1.2 gFPSに組み込むことができるペプチドの長さの調査
1.3 gFPSに組み込んだHER2結合ペプチドの結合評価
2.高性能標的結合ペプチドのスクリーニング法の開発
2.1 gFPSの酵母ディスプレイと標的結合評価
2.2 高性能標的結合ペプチドのスクリーニング法
おわりに
第6節 cDNAディスプレイ法によるペプチドスクリーニング技術
はじめに
1.cDNA ディスプレイ法の特徴
1.1 cDNA ディスプレイ法とmRNA ディスプレイ法
1.2 cDNA ディスプレイ法に用いるピューロマイシン・リンカー
1.3 ピューロマイシン・リンカーを用いた迅速な分子間相互作用解析
2.cDNAディスプレイ法によるペプチドスクリーニング
2.1 IL-6Rに対する環状ペプチドアプタマーの取得
2.2 GPCRに結合するペプチドアプタマーの生細胞スクリーニング
2.3 ペプチドライブラリーを用いた酵素基質の網羅的評価
2.4 がん細胞特異的な膜透過ペプチドの探索
おわりに
第7節 ペプチドビーズライブラリーを用いた標的探索
はじめに
1.ペプチドライブラリーの構築
2.ペプチドビーズライブラリーを用いたスクリーニングと探索
3.選別ペプチドビーズの配列解析(deconvolution)
おわりに
第8節 標的分子とタンパク質ライブラリーのペリプラズム発現によるスクリーニング技術
はじめに
1.ペプチドディスプレイ技術
1.1 無細胞合成系ペプチドディスプレイ技術
1.2 細胞表層系ペプチドディスプレイ技術
1.3 大腸菌ペリプラズムペプチドディスプレイ技術
2.ペプチドディスプレイに適用する鋳型ペプチド
3.ペリプラズム発現スクリーニングにおける標的分子
3.1 膜タンパク質
3.2 可溶性タンパク質
4.Intra periplasm secretion and selection (PERISS)法
4.1 PERISS法の原理
4.2 PERISS法の実施例
4.3 PERISS法の利点と欠点
5.今後の展開
第9節 化学修飾ペプチドファージライブラリの構築と標的タンパク質に対するリガンドスクリーニング
はじめに
1.化学修飾によるbicyclicペプチドファージライブラリの構築とプロテアーゼ阻害ペプチドのスクリーニング
2.糖修飾によるレクチン指向型糖ペプチドファージラリブラリの構築とレクチン結合性糖ペプチドリガンドのスクリーニング
3.M13ファージの直接修飾によるペプチドファージライブラリの拡張
4.T7ファージを利用した化学修飾ペプチドファージライブラリ
5.システイン残基を介さないペプチドファージライブラリの化学修飾法
第10節 糖鎖修飾の多様性に着目した糖ペプチドライブラリ構築技術
はじめに
1.糖ペプチド合成の基礎
1.1 O-結合型糖鎖を有する糖ペプチドの合成戦略
1.1.1 糖アミノ酸の入手
1.1.2 糖ペプチドの固相合成
1.1.2 糖転移酵素による糖鎖伸長
2.糖鎖自動合成法による糖ペプチドライブラリ構築の加速戦略
2.1 水溶性プライマー法による糖鎖自動合成法
2.2 水溶性プライマー法による糖ペプチドライブラリの迅速構築
3.糖ペプチドライブラリの利用を想定したライブラリ構築戦略
3.1 ムチン型糖ペプチドライブラリを用いたエピトープ解析
3.2 糖ペプチド提示ナノ粒子をもちいた動態解析
3.3 小規模糖ペプチドライブラリを用いたNMRによる糖ペプチド配座解析
4.糖ペプチドライブラリ構築技術の展望
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